“醫(yī)學(xué)界正齊心協(xié)力為新型冠狀病毒開發(fā)快速、可靠的診斷方法?！苯?，一篇發(fā)布在學(xué)術(shù)期刊《自然·生物技術(shù)》的新聞稿詳細梳理國際醫(yī)學(xué)界在研發(fā)新型冠狀病毒診斷方法中的努力。文章稱，國際研究團隊迅速開展工作，在創(chuàng)紀(jì)錄的時間內(nèi)進行病毒檢測。

文章指出，疫情爆發(fā)之初，三個研究團隊鑒定并分享了新冠病毒基因序列信息，“為識別該病毒做出了驚人的努力”。

由上海、武漢、北京和悉尼的研究人員組成的團隊采用宏基因組測序，從一位武漢華南海鮮市場的病人身上提取樣本，鑒定出一種未知冠狀病毒。這個研究團隊在1月10日首次將它的初步基因組序列存放在GenBank公開數(shù)據(jù)庫中。

與此同時，中國疾病預(yù)防控制中心派出的團隊從3名患者的支氣管肺泡灌洗液中分離并培養(yǎng)出一種新型冠狀病毒。電鏡圖像表明這一病毒具有典型的冠狀病毒形態(tài)?；蚪M測序表顯示，它與蝙蝠體內(nèi)的SARS樣冠狀病毒具有85%的相似性。在1月12日，這一研究團隊將3個基因組序列存放在可公開查詢的GISAID數(shù)據(jù)庫中。

第三個研究團隊來自武漢和北京，他們從另外5名嚴(yán)重肺炎患者中發(fā)現(xiàn)了同一病毒，并且將5個基因組序列存放GISAID數(shù)據(jù)庫中。研究團隊還發(fā)現(xiàn)這一病毒使用ACE2受體進入宿主細胞。

首個新型冠狀病毒診斷測試方法

上述三個團隊的公開數(shù)據(jù)為病毒診斷提供了基礎(chǔ)?！蹲匀弧ど锛夹g(shù)》表示，許多國際組織利用這些序列數(shù)據(jù)設(shè)計聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)檢測的引物，從而支持全球公共衛(wèi)生實驗室在沒有商業(yè)檢測方法的情況下開展病毒檢測工作。

1月23日，德國柏林夏里特（Charité）醫(yī)院病毒學(xué)研究所克里斯蒂安·德羅斯滕（Christian Drosten）教授與其他幾位歐洲及香港合作者發(fā)布了新型冠狀病毒的實時PCR（RT-PCR）診斷測試方法和流程。這項工作被認(rèn)為是首個新型冠狀病毒診斷測試方法，也成為世界衛(wèi)生組織（WHO）使用的SARS-CoV-2分子檢測試劑盒的基礎(chǔ)。它能夠?qū)ARS-CoV-2與SARS-CoV區(qū)分開。《自然·生物技術(shù)》稱，近幾周來，WHO已經(jīng)向世界上159個檢測實驗室運送了25萬個分子檢測試劑盒。

德羅斯滕團隊在沒有SARS-CoV-2分離株或患者樣本的情況下驗證了該試驗，并在297份其他各類呼吸道感染患者的臨床樣本中證實了測試方法的特異性。

德羅斯滕在接受科技日報采訪時介紹，他們聯(lián)合倫敦、香港、鹿特丹等地的實驗室，做了大量的試驗，證明其測試只針對新型冠狀病毒，對于其他的病毒不會產(chǎn)生陽性反應(yīng)。他還表示，中國在1月10日公布新型冠狀病毒的全基因序列對其研發(fā)針對性診斷套件非常的重要?！拔覀冊诖酥熬鸵呀?jīng)有了原則性測試，但是直到這個基因序列公布，我們才能夠看到，我們的方法是正確的，可以準(zhǔn)確探測到這一新的病毒?！?/p>

1月31日，香港大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授Leo Poon團隊基于GenBank上的第一個新型冠狀病毒基因組序列，開發(fā)了兩種RT-PCR方法。這兩個測試方法在從SARS-CoV-2感染者身上獲得的兩個臨床樣本中進行了驗證。據(jù)《自然·生物技術(shù)》報道，Leo Poon的團隊已經(jīng)與世衛(wèi)組織以及亞洲、非洲、中東和南美的30多個實驗室分享了測試細節(jié)和試劑。

美國方面，在2月4日獲得美國食品和藥物管理局（FDA）的緊急使用授權(quán)后，美國疾病控制和預(yù)防中心（CDC）也向全美50個州以及全球30個地區(qū)推出了自己PCR檢測方法。

商業(yè)試劑盒與宏基因組檢測的加入

這些早期的實驗室測試為防控疫情爭取了寶貴的時間，在商業(yè)化試劑盒大規(guī)模供應(yīng)之前，它們?yōu)楣残l(wèi)生部門提供了診斷工具。隨后，商業(yè)公司開始參與其中。2020年1月底，華大基因在中國各地分發(fā)了超過5萬個試劑盒。2月5日，該公司在武漢開設(shè)了一個“火眼”緊急檢測實驗室，每天可處理10000份樣品。《自然·生物技術(shù)》稱，除華大基因外，其他公司研發(fā)測試方法的速度慢得多。

在德國漢堡，一家名為Altona Diagnostics的診斷公司正在開發(fā)一種針對β-冠狀病毒E基因和SARS-CoV-2病毒S基因的兩部分檢測方法。

美國公司IDbyDNA則采取宏基因組核酸分析作為常規(guī)診斷和監(jiān)測工具。該公司現(xiàn)有的測試方法能夠從患者樣本的宏基因組數(shù)據(jù)中識別出900多種呼吸病原體，包括病毒、細菌、真菌和寄生蟲。公司的聯(lián)合創(chuàng)始人兼首席醫(yī)療官說，他們已經(jīng)用新型冠狀病毒更新了數(shù)據(jù)，正在重新驗證測試方法。目前，該公司正在對外銷售這項技術(shù)及測試服務(wù)。

英國愛丁堡大學(xué)的進化生物學(xué)研究所分子進化教授Andrew Rambaut正在通過分析不同SARS-CoV-2基因組之間的譜系關(guān)系來追蹤疫情。一項基于90個公開基因組的初步分析表明，SARS-CoV-2病毒出現(xiàn)于武漢第一例新型冠狀病毒肺炎發(fā)生之前不久。

還有其他流行病學(xué)家設(shè)計出數(shù)字監(jiān)控工具，通過自動監(jiān)控官方和非官方的電子信息跟蹤疫情。例如，美國約翰霍普金斯大學(xué)的研究人員匯總了官方和媒體關(guān)于疫情發(fā)展的報道，實現(xiàn)對SARS-CoV-2病例的實時可視化和跟蹤報告。截至2月19日，該系統(tǒng)已有7800多個病例的人口、地理和臨床資料，可供研究人員分析并了解傳播模式。